Βυζαντινή Περίοδος (Αυτοκρατορία)
Μοντέλα ιστορικών πλοίων βυζαντινών χρόνων: Ξεχωρίζει το μοντέλο του πλοίου «Κουμπαρέα- Κουμβάριον». Τέτοιου είδους πλοία είχαν οι Μουσουλμάνοι της Κρήτης και ειδικά οι Άραβες. Μάλιστα η ονομασία τους προέρχεται από τις αραβικές λέξεις markab kabir οι οποίες σημαίνουν μακρύ πλοίο. Οι Βυζαντινές ιστορικές πηγές όταν κάνουν λόγο για Αραβικά πλοία, αναφέρονται στα «κουμβάρια», αφού έτσι ονομάζονταν τα Μουσουλμανικά πλοία της Κρήτης. Τα μεγάλα και βραδυκίνητα «κουμβάρια» χρησιμοποιούνταν και από τους Σαρακηνούς. Σημαντικά είναι και τα μοντέλα των πλοίων «Δρόμωνας» (6ος αι. μ.Χ.), «Γιασί Αντά» (7ος αι. μ.Χ.) και «Σεμπέκ»(17ος αιώνας). Η συλλογή πλαισιώνεται από πορτρέτα των σημαντικότερων αυτοκρατόρων του Βυζαντίου, πίνακες βυζαντινών πλοίων αλλά και από μία ψηφιακή παρουσίαση της Βυζαντινής Ιστορίας.