Συλλογή Ψηφιδωτών
Τη συλλογή ψηφιδωτών απαρτίζουν ψηφιδωτά δάπεδα προερχόμενα ως επί το πλείστον από ανασκαφές σε οικόπεδα του κέντρου της πόλης της Θεσσαλονίκης, όπου αποκαλύφθηκαν αστικές κατοικίες αλλά και λαμπρά δημόσια κτίρια. Άλλοτε απεικονίζονται πολυπρόσωπες παραστάσεις με μυθολογικό περιεχόμενο, άλλοτε τα θέματα είναι καθαρά διακοσμητικά, με γεωμετρικά ή φυτικά σχέδια, ενώ δεν λείπουν οι αλληγορικές και συμβολικές σκηνές. Στη συλλογή περιλαμβάνονται πολύ σημαντικές συνθέσεις, όπως ο μυθικός γάμος του Διονύσου με την Αριάδνη (3ος αι. μ.Χ), το οποίο προέρχεται από την αίθουσα τρικλινίου πλούσιας κατοικίας και εκτίθεται σε περίοπτη θέση της μόνιμης έκθεσης του μουσείου. Χρονολογικά τα ψηφιδωτά της συλλογής του Μουσείου εκτείνονται από τον 2ο ως τον 4ο αι. μ. Χ, περίοδο ακμής της ρωμαϊκής Θεσσαλονίκης.